甲型肝炎
多數病人可在家休養，以支持治療即可；支持療法包括臥床休息、戒酒及適當營養食品。由發病日期計算，病人多會在3 - 6個月內完全康復。

乙型肝炎
乙型肝炎並無有效療法。有兩種藥物用于治療慢性乙型肝炎，可減慢病情的進展，繼而阻止肝硬化及肝癌的發生。

Lamivudine 是口服藥物，此藥適用於病毒正在體內複製的慢性乙型肝炎患者，也適用於活動性肝炎的患者。患者對本藥的反應良好，而且副作用又少，現今常用於病毒複製活躍的慢性乙型肝炎患者。

干擾素 是一種注射性藥物，適用於18歲以上的乙型肝炎患者。注射劑量視乎病人的反應，以皮下或肌肉注射，需每天或每星期三次。少於一半的患者對此藥有反應，且停藥後會復發。很多患者不能耐受此藥，因此常常發生過早停藥。常見副作用有感冒症狀，如發燒、發冷、疲倦、肌肉疼痛、噁心嘔吐，更嚴重的有血液問題、抑鬱、及甲狀腺病。由於副作用多，本藥不適用于嚴重肝病患者，特別是有肝硬化併發症人士。

肝移植手術 適合嚴重急性肝衰竭患者。不幸地，重新移植的肝臟會再次感染乙肝病毒，因為即使除去舊有的肝臟患者仍不能完全消滅體內的病毒。然而病人重複感染發生時間有差異，可於手術後應用Lamivudine及乙型肝炎免疫球蛋白避免。這項手術可延長患者的生存期，及減少肝炎的併發症。

丙型肝炎
與乙型肝炎情況相似，至今丙型肝炎並無有效療法。在美國有兩種藥物已獲准應用於此型治療：干擾素及干擾素和Ribavirn結合使用。現今結合用藥是慢性丙型肝炎常用療法，因為有效反應時間長，而只在不能耐受Ribavirn才單獨應用干擾素。Ribavirn是口服藥物，直至最近，美國食品及藥物管理局才批准結合干擾素使用於治療上。Ribavirn的主要副作用是血液問題如溶血性貧血，也可引致畸胎，所以孕婦禁用。

最近，有新型的干擾素批出市場，這種改良的劑型每星期只需注射一次，比起舊有的常用劑型更方便，改良干擾素現正研究與Ribavirin結合使用。

肝硬化患者可選擇接受肝臟移植手術，雖然移植的肝臟無可避免地會再次感染，但可使丙型肝炎患者生命期延長及提升患者生活質素。